关于东线一期工程原水的平均成本估算不一，有的专家认为大概为1.5元/立方米左右，有的专家则认为高达2-3元/立方米。即便是按照前者估算的话，那么再加上到水厂和管网的成本，可能终端水的成本将达到4-5元/立方米。

　　而这一水平可能超过南水北调受水地区部分城市的居民用水的价格。以德州为例，根据2010年执行的《德州市供水总公司水费价格明细表及收费依据》，该地区居民用水价格为2.95元/立方米。

　　前述专家分析，这意味着可能南水北调的水成本比较高，当地居民用户在价格上接受起来有困难，那么当地政府是否要补贴？如果不补贴的话，当地居民可能还是倾向用地下水。外调水和地下水如何协调，这都有待进一步明确。也许有些受水区的城市，会提出，我能否不要外调水？

　　根据今年8月公开征求意见的《南水北调工程供用水管理条例》草案规定，南水北调工程实行基本水价和计量水价相结合的两部制水价。受水区各省、直辖市人民政府应当按照国务院批准的多年平均调水量和受水区各省、直辖市水量分配指标，在水量调度年度开始前向国务院财政主管部门缴纳基本水费，并按照年度引水量缴纳计量水费。